Flere store undersøgelser viser, at risikoen for abort og misdannelser ved både ICSI og IVF er en smule højere end for graviditeter opstået naturligt. Det ser ikke ud til, at selve IVF/ICSI- behandling øger risikoen. De infertile par, der har behov for IVF/ICSI-behandling, har i sig selv en let øget risiko for, at børnene kan få misdannelser.
Der er ingen speciel grund til at få udført moderkagebiopsi eller fostervandsprøve efter IVF/ICSI-behandling.